RNasa: comparándote con la nieve en un día de invierno

Comparación de la RNasa

La reproducibilidad, la sostenibilidad y los recursos son temas de gran importancia para los científicos de laboratorio. ¿Podría haber ahora algunas soluciones a estas preocupaciones para quienes trabajan con el ARN?

Utilizando numerosos conjuntos de placas de 96 pocillos colocados en varios lugares y dejados en el transcurso de un día, el equipo observó que algunos pocillos estarían completamente libres de contaminación por RNasa, y otros estarían completamente contaminados. Llegaron a la conclusión de que se trataba de algo completamente esporádico, sin dependencia alguna.

"Esperábamos que fuera como la acumulación de nieve en un día de invierno: estable y constante. Pero, en cambio, puede ser repentina, inesperada y catastrófica. No es fácil de definir. Puede no haber contaminación durante una hora de dejar el equipo fuera, o puede estar contaminado en el momento en que se abre un paquete estéril", explica Theresa Thompson, científica de aplicaciones de Phoseon Technology.

Por lo tanto, se puede concluir fácilmente cómo la contaminación por RNasa conduciría a un aumento de los residuos, a la pérdida de tiempo y a problemas de reproducibilidad. Estos tres problemas son increíblemente oportunos si se tiene en cuenta la sociedad, la política y la sostenibilidad.

Trabajar con tampones Tris

En cualquier camino de investigación del ARN; si hay alguna degradación de la muestra, los resultados pueden ser inconsistentes, inexactos y difíciles de obtener. Aunque la RNasa es increíblemente resistente a la inactivación, las rutas habituales de descontaminación de la RNasa incluyen el tratamiento con DEPC durante la noche y la esterilización en autoclave, lo que consume mucho tiempo.

Muchos experimentos se llevan a cabo en tampones Tris. Estos tampones no pueden someterse a los mismos métodos de descontaminación, ya que el DEPC ataca a los grupos aminos del Tris, limitando su capacidad amortiguadora y destruyéndose en el proceso, por lo que es incapaz de inactivar cualquier RNasa contaminante.

Phoseon Technology descubrió que una longitud de onda ultravioleta de 280 nm puede dirigirse a la RNasa A, dejándola inactivada de forma irreversible, sin que se produzcan cambios en el pH o en la capacidad de amortiguación de los tampones Tris. Desde entonces, Phoseon ha incorporado esto a su propia plataforma tecnológica novedosa, KeyPro™, formada por luces de alta intensidad basadas en LED que pueden alcanzar intensidades que no se han logrado con otras fuentes de luz.

El KeyPro KP100

Inmediatamente antes de realizar cualquier experimento, se enciende la plataforma y, en menos de 5 minutos, todo el equipo, incluidos los tampones Tris, está completamente descontaminado de RNasa. Las formas en las que esta plataforma puede beneficiar a los investigadores, se pueden dibujar en un panorama mucho más amplio de los problemas clave para los científicos en este momento.

Reproducibilidad

La crisis de la reproducibilidad es una crisis actual y continua en las ciencias de la vida, en la que muchos métodos experimentales no pueden reproducirse. La reproducibilidad de los experimentos es una parte esencial del método científico, ya que las investigaciones e hipótesis posteriores se basan en la suposición justa, pero falsa, de que estas investigaciones irreproducibles pueden reproducirse.

Como ya sabemos, la contaminación por RNasa es aleatoria. Mientras que algunos pocillos de una placa de 96 pocillos podrían estar completamente libres de RNasa, otros también podrían estar completamente contaminados.

"La plataforma es diferente a la de un autoclave: es un sistema de iluminación de estado sólido, con calibración para garantizar que siempre se suministra la misma cantidad de luz. Incluso cuando los propios diodos envejecen y un diodo individual tiene menos potencia, el sistema lo compensa cada vez que se ejecuta. El mismo protocolo que se ejecuta hoy va a dar el mismo rendimiento dentro de 5 años", comentó Jay Pasquantonio, director de productos de Phoseon Technology.

La luz garantiza la misma descontaminación en los 96 pocillos de la placa, por lo que no hay que preocuparse de que los resultados varíen en función de la presencia de RNasa en determinados pocillos. La desconfianza del público en los científicos está en su punto más alto, con la crisis de reproducibilidad que invalida las teorías y las noticias falsas. Por lo tanto, cualquier garantía de reproducibilidad será reconfortante.

Recursos

La financiación de la investigación científica es actualmente motivo de preocupación para muchas escuelas, institutos y universidades. Los entornos políticos inestables han llevado a recortar los gastos y a planificar los fondos con más cuidado. La compra de tampones de Tris sin RNasa es cara, además de potencialmente derrochadora e insostenible.

El tiempo como recurso también es cada vez más escaso. Con personas que trabajan más horas para conseguir resultados, el tiempo es realmente esencial. KeyPro tarda menos de 5 minutos en descontaminar los tampones Tris de RNasa y prepararlos para su uso. El experimento puede ejecutarse inmediatamente después. Esto ahorra enormes cantidades de tiempo en comparación con los métodos tradicionales de descontaminación.

Una demostración del tiempo que se puede ahorrar utilizando KeyPro en comparación con los métodos tradicionales de contaminación.

Además, una vez que se produce la contaminación por RNasa, que podría ser tan pronto como la exposición al aire, el experimento tendrá que ser descartado y el proceso de descontaminación tendrá que ser completado de nuevo, lo que significa que los investigadores podrían encontrarse perdiendo enormes períodos de tiempo innecesariamente.

Sostenibilidad

El uso del sistema KeyPro no sólo tiene el potencial de limitar los residuos de plásticos de un solo uso, sino que también puede limitar los volúmenes de residuos de reactivos, tampones y productos, que también pueden ser bastante costosos. Si los tampones se descontaminan inmediatamente antes de su uso, se toman pequeños volúmenes y se utilizan de inmediato, por lo que los niveles de residuos pueden mantenerse bajos, ya que no es necesario desechar ninguna solución potencialmente contaminada y no hay un exceso innecesario.

En conclusión, el KeyPro resuelve problemas que están en el corazón y la mente de los científicos de la vida, que se combinan para hacer la vida un poco más fácil. Ya sea el ahorro de tiempo en la descontaminación, que puede dedicarse mejor a la familia o a los amigos, el ahorro de dinero, que puede dedicarse mejor a otros recursos clave, o la limitación de la cantidad de residuos producidos por la investigación de un individuo, y la contribución a garantizar un futuro más sostenible.

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