RNase: comparándote con la nieve en un día de invierno

Comparación de RNasa

La reproducibilidad, la sostenibilidad y los recursos son actualmente muy importantes en la agenda y más importantes que nunca para los científicos de laboratorio. ¿Podría haber ahora algunas soluciones a estas preocupaciones para quienes trabajan con ARN?

Utilizando numerosos conjuntos de placas de 96 pocillos colocados en varios lugares y dejados en el transcurso de un día, el equipo observó que algunos pozos estarían completamente libres de contaminación por RNasa y algunos estarían completamente contaminados. Concluyeron que fue completamente esporádico, sin dependencia.

“Esperábamos que fuera como la acumulación de nieve en un día de invierno: constante y constante. Pero en cambio, puede ser repentino, inesperado y catastrófico. No se define fácilmente. Es posible que no haya contaminación durante una hora de dejar el equipo afuera, o podría contaminarse en el momento en que abre un paquete estéril ”, explicó Theresa Thompson, científica de aplicaciones en Phoseon Technology.

Por lo tanto, se puede concluir fácilmente cómo la contaminación por ARNasa conduciría a un mayor desperdicio, pérdida de tiempo y problemas de reproducibilidad. Estos tres problemas son temas increíblemente actuales cuando se consideran la sociedad, la política y la sostenibilidad.

Trabajar con búferes Tris

En cualquier camino de la investigación del ARN; si hay alguna degradación de la muestra, los resultados pueden ser inconsistentes, inexactos y difíciles de obtener. Aunque la ARNasa es increíblemente resistente a la inactivación, las rutas habituales de descontaminación de la ARNasa incluyen el tratamiento con DEPC durante la noche y la esterilización en autoclave, que consume mucho tiempo.

Se llevan a cabo muchos experimentos en tampones Tris. Estos tampones no pueden someterse a los mismos métodos de descontaminación, ya que el DEPC ataca los grupos amino del Tris, limitando su capacidad tampón y destruyéndose a sí mismo en el proceso dejándolo incapaz de inactivar ninguna RNasa contaminante.

Phoseon Technology descubrió que una longitud de onda UV de 280 nm puede apuntar a la ARNasa A, dejándola inactivada de forma irreversible, sin desviaciones en el pH o la capacidad amortiguadora de los tampones Tris. Desde entonces, Phoseon ha incorporado esto en su propia plataforma de tecnología novedosa, KeyPro ™, formada por luces LED de alta intensidad que pueden alcanzar intensidades que no se han logrado con otras fuentes de luz.

El KeyPro KP100

Inmediatamente antes de ejecutar cualquier experimento, se enciende la plataforma y, en menos de 5 minutos, todo el equipo, incluidos los tampones Tris, se descontaminan por completo de RNasa. Las formas en que esta plataforma puede beneficiar a los investigadores se pueden dibujar en una imagen mucho más amplia de los problemas clave para los científicos en este momento.

Reproducibilidad

La crisis de reproducibilidad es una crisis actual y continua en las ciencias de la vida, en la que muchos métodos experimentales no pueden reproducirse. La reproducibilidad de los experimentos es una parte esencial del método científico, ya que las investigaciones e hipótesis posteriores se basan en la suposición justa pero falsa de que estas piezas de investigación irreproducibles pueden reproducirse.

Como sabemos ahora, la contaminación por RNasa es aleatoria. Si bien algunos pocillos en una placa de 96 pocillos pueden estar completamente libres de RNasa, algunos también podrían estar completamente contaminados.

“La plataforma es diferente a un autoclave: es un sistema de iluminación de estado sólido, con calibración para garantizar que siempre se entregue la misma cantidad de luz. Incluso cuando los diodos envejecen y un diodo individual tiene menos salida; el sistema lo compensa cada vez que se ejecuta. El mismo protocolo que ejecuta hoy le dará el mismo resultado dentro de 5 años ”, comentó Jay Pasquantonio, Gerente de Producto Senior de Phoseon Technology.

La luz asegura la misma descontaminación en los 96 pozos de la placa, por lo que no hay necesidad de preocuparse por los resultados variables según la presencia de RNasa en pozos particulares. La desconfianza pública en los científicos está en su punto más alto, con la crisis de reproducibilidad que invalida las teorías y abundan las noticias falsas. Por lo tanto, cualquier seguridad de reproducibilidad traerá consuelo.

Recursos

La financiación de la investigación científica es actualmente motivo de preocupación para muchas escuelas, colegios y universidades. Los entornos políticos inestables han llevado a recortes de costos y una planificación de fondos más cuidadosa. La compra de tampones Tris sin RNasa es costosa, además de ser potencialmente inútil e insostenible.

El tiempo como recurso también se está volviendo cada vez más tenso. Con personas que trabajan más horas para lograr resultados, el tiempo es realmente esencial. KeyPro tarda menos de 5 minutos en descontaminar los tampones Tris de RNase y prepararlos para su uso. El experimento se puede ejecutar inmediatamente después. Esto ahorra una gran cantidad de tiempo en comparación con los métodos tradicionales de descontaminación.

Una demostración del tiempo que se puede ahorrar con KeyPro en comparación con los métodos tradicionales de contaminación.

Además, una vez que se produce la contaminación por RNasa, que podría ser tan pronto como la exposición al aire, el experimento deberá descartarse y el proceso de descontaminación deberá completarse nuevamente, lo que significa que los investigadores podrían encontrarse desperdiciando grandes períodos de tiempo innecesariamente.

Sustentabilidad

El uso del sistema KeyPro no solo tiene el potencial de limitar los residuos plásticos de un solo uso, sino que también puede limitar los volúmenes de residuos de reactivos, tampones y productos, que también pueden resultar bastante costosos. Si los tampones se descontaminan inmediatamente antes de su uso, se toman pequeños volúmenes y se utilizan inmediatamente, por lo tanto, los niveles de desechos se pueden mantener bajos, ya que no es necesario eliminar las soluciones potencialmente contaminadas y no hay un exceso innecesario.

Para concluir, KeyPro conquista problemas cercanos al corazón y la mente de los científicos de la vida, que se combinan para hacer la vida un poco más fácil. Ya sea para ahorrar tiempo en la descontaminación que se puede gastar mejor con la familia o los amigos, ahorrar dinero que se puede gastar mejor en otros recursos clave o limitar la cantidad de desechos producidos a partir de la investigación de una persona y contribuir a garantizar un futuro más sostenible.

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